アイヌのミトコンドリア・ハプログループ [ゲノム解析で古代史]
自分のための備忘録です。
縄文人に多いY染色体のハプログループDは、本土の日本人よりアイヌや沖縄に多いのです。
しかし…アイヌに多いとされる、ミトコンドリアのハプログループYは本土や沖縄の日本人にはほとんど見られません。
出所 https://twitter.com/studying_Ainu/status/1362309943664156674
これは、学術研究でも確かめられています。
形態と遺伝子から解明する近世アイヌ集団の起源と成立史
研究代表者 篠田 謙一
また、このアイヌに多いとされるミトコンドリアのハプログループYは、縄文人にも見られません。
なお、血液型から見ても、アイヌはO型が多い点でオホーツク人と共通しています。
縄文人に多いY染色体のハプログループDは、本土の日本人よりアイヌや沖縄に多いのです。
だから、アイヌは現代日本人より縄文人に近いという話もしばしば聞きます。#barakanbeat 沖縄とアイヌのことで思い出したこのグラフ。東アジアのY染色体ハプログループ（Yせんしょくたいハプログループ）とは、父系で遺伝するY染色体のハプログループ）を示すものです。 pic.twitter.com/geWDZn8fr6
— Peter Barakan (@pbarakan) July 12, 2020
しかし…アイヌに多いとされる、ミトコンドリアのハプログループYは本土や沖縄の日本人にはほとんど見られません。
出所 https://twitter.com/studying_Ainu/status/1362309943664156674
これは、学術研究でも確かめられています。
形態と遺伝子から解明する近世アイヌ集団の起源と成立史
研究代表者 篠田 謙一
近世アイヌ人骨122体を対象としてDNAを抽出し、ミトコンドリアDNAの解析を行った。最終的に100体からDNA情報を取得し、アイヌ集団の成立の歴史の解明を試みた。解析の結果は、北海道のアイヌ集団は在来の縄文人の集団にオホーツク文化人を経由したシベリア集団の遺伝子が流入して構成されたというシナリオを支持した。また同時に行った頭蓋形態小変異の研究でも、アイヌは北海道の祖先集団に由来するものの、オホーツク人との間の遺伝的な交流を持っていた可能性が示された。出所 https://kaken.nii.ac.jp/ja/grant/KAKENHI-PROJECT-22370088/
また、このアイヌに多いとされるミトコンドリアのハプログループYは、縄文人にも見られません。
なお、血液型から見ても、アイヌはO型が多い点でオホーツク人と共通しています。
2023-09-10 09:17
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北朝鮮のタバコの吸い殻によるY染色体ハプログループの推定 [ゲノム解析で古代史]
自分のための備忘録です。
北朝鮮のタバコの吸殻からY染色体のハプログループを推定した研究があります。
Jeong, KS., Shin, H., Lee, SJ. et al. Genetic characteristics of Y-chromosome short tandem repeat haplotypes from cigarette butt samples presumed to be smoked by North Korean men. Genes Genom 40, 819–824 (2018). https://doi.org/10.1007/s13258-018-0701-5
結論として、"For the 16 Y-filer loci and eight minimal loci, respectively 90.9 and 82.6% of the matched haplotypes were estimated to belong to haplogroup O, representing the Southeast and East Asian type."とあり、ハプログループOが82.6%または90.9%との推定です。
また、"Despite the separation between North and South Korea for 70 years, they can still be considered a single genetic population, based on Y-STR haplotypes."ともあり、「70年もの間、南北朝鮮が分離していたにもかかわらず、Y-STRハプロタイプに基づくと、両者は依然として単一の遺伝的集団とみなすことができる。」とのこと。
なお、元のソースが不明ですが、このサイトによると、ハプログループOは83%となっています。
↓は、古代の西遼河（旧・満州）のY染色体の分析です。
Cui, Y., Li, H., Ning, C. et al. Y Chromosome analysis of prehistoric human populations in the West Liao River Valley, Northeast China. BMC Evol Biol 13, 216 (2013). https://doi.org/10.1186/1471-2148-13-216
結論として、ハプログループNが62.5%で、現在中国で主流のO2（この表は旧表記のためO3）は21.9%で、弥生人・現代日本人に多いO1b2（同O2）は見つかりませんでした。
紅山文化は日本の縄文人と交流があったとされますが、縄文人で主流のD1a2aは見つかりませんでした。
別の論文、
Melinda A. Yang et al. Ancient DNA indicates human population shifts and admixture in northern and southern China. Science 369,282-288(2020).DOI:10.1126/science.aba0909
では、古代中国のDNAの主成分分析を行いました。
日本人は、黄河下流の人々に近いのですが、別のグループのようです。
下の図のCを見ると、伊川津の縄文人と現代日本・韓国人は極めて近く、やはり縄文人がそのまま弥生人になったと考えるのが一番素直なようです。
なお、伊川津の縄文人2体については、ミトコンドリアのハプログループはどちらもM7a1aですが、親子ではないとのことです。
Complete mitochondrial genome sequencing reveals double-buried Jomon individuals excavated from the Ikawazu shell-mound site were not in a mother–child relationship
Anthropological Science 2022
https://www.jstage.jst.go.jp/article/ase/advpub/0/advpub_220129/_pdf/-char/ja
北朝鮮のタバコの吸殻からY染色体のハプログループを推定した研究があります。
Jeong, KS., Shin, H., Lee, SJ. et al. Genetic characteristics of Y-chromosome short tandem repeat haplotypes from cigarette butt samples presumed to be smoked by North Korean men. Genes Genom 40, 819–824 (2018). https://doi.org/10.1007/s13258-018-0701-5
結論として、"For the 16 Y-filer loci and eight minimal loci, respectively 90.9 and 82.6% of the matched haplotypes were estimated to belong to haplogroup O, representing the Southeast and East Asian type."とあり、ハプログループOが82.6%または90.9%との推定です。
また、"Despite the separation between North and South Korea for 70 years, they can still be considered a single genetic population, based on Y-STR haplotypes."ともあり、「70年もの間、南北朝鮮が分離していたにもかかわらず、Y-STRハプロタイプに基づくと、両者は依然として単一の遺伝的集団とみなすことができる。」とのこと。
なお、元のソースが不明ですが、このサイトによると、ハプログループOは83%となっています。
↓は、古代の西遼河（旧・満州）のY染色体の分析です。
Cui, Y., Li, H., Ning, C. et al. Y Chromosome analysis of prehistoric human populations in the West Liao River Valley, Northeast China. BMC Evol Biol 13, 216 (2013). https://doi.org/10.1186/1471-2148-13-216
結論として、ハプログループNが62.5%で、現在中国で主流のO2（この表は旧表記のためO3）は21.9%で、弥生人・現代日本人に多いO1b2（同O2）は見つかりませんでした。
紅山文化は日本の縄文人と交流があったとされますが、縄文人で主流のD1a2aは見つかりませんでした。
別の論文、
Melinda A. Yang et al. Ancient DNA indicates human population shifts and admixture in northern and southern China. Science 369,282-288(2020).DOI:10.1126/science.aba0909
では、古代中国のDNAの主成分分析を行いました。
日本人は、黄河下流の人々に近いのですが、別のグループのようです。
下の図のCを見ると、伊川津の縄文人と現代日本・韓国人は極めて近く、やはり縄文人がそのまま弥生人になったと考えるのが一番素直なようです。
なお、伊川津の縄文人2体については、ミトコンドリアのハプログループはどちらもM7a1aですが、親子ではないとのことです。
Complete mitochondrial genome sequencing reveals double-buried Jomon individuals excavated from the Ikawazu shell-mound site were not in a mother–child relationship
Anthropological Science 2022
https://www.jstage.jst.go.jp/article/ase/advpub/0/advpub_220129/_pdf/-char/ja
2023-09-10 08:16
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ミトコンドリア・ハプログループD4a1は本当に渡来系なのか？【続々】 [ゲノム解析で古代史]
前回の続きです。これまた、自分のための備忘録となります。
その後、篠田謙一氏が2016年3月19日にJICAで講演したスライドを見つけました。
DNAから見た日本人の起源―日本人成立の経緯―
国立科学博物館人類研究部 篠田 謙一
そうしたら、なんとその後の2019年の自著↓の記述を否定していたのです！
1. この本には、ミトコンドリア・ハプログループDは「弥生時代になって日本に入ってきたと考える方が自然」（第5章）とありますが、講演のスライド↓には縄文人のD4が示されています。
これは、 ハプログループDは縄文時代に既に入ってきていたということ？ 以前の主張を変更したとは思えないので、非常に考えにくいのですが、ひょっとしたら書き間違え？
2. 講演のスライド↓では、ハプログループD4の中心は山東省や朝鮮半島になっていますが、前回に書いたように、その比率は20%台となります。これは日本の30%台より低いので、中心は山東省ではなく日本です。
3. 山東省の斉の国から山口県下関市・土井ヶ浜遺跡に到来したとされる人々（DHxx）のハプログループD4は、主成分分析の結果によると、現在の日本人のD4のものと同じもののようです。
Diversity in matrilineages among the Jomon individuals of Japan
Fuzuki Mizuno et al.
Annals of Human Biology 2023
ただ、↑の2を考慮すると、実は山東省のD4が縄文・弥生人由来なのか、あるいは縄文・弥生人が山東省に移住したものの、何らかの理由で里帰りしたのか…。
これだけではなんとも言えないので、より詳しい分析が必要になるでしょう。
常識的に考えると、わざわざ300人も来たとなると、何らかの新技術（たとえば最新の水田稲作技術）を持ってきたか、あるいは里帰りとするのが自然だと思います。
↑でもう一つ面白いことは、縄文人（黄色）や弥生人（紫色）のミトコンドリア・ハプログループは、土井ヶ浜遺跡の人々も含め、すべて現代日本人と同じであることです。
これには、
a. そもそも、ミトコンドリア・ハプログループでは地域性を区別しにくい
b. 弥生時代までには、渡来人は無視できるぐらい少人数しか来なかった
c. 半島動乱の時代に日本に渡来した百済・新羅・漢人と同じグループだった
といった可能性が考えられます。
まぁ、なんとも言えませんが、私は個人的にbではないかと思っています。
いずれにしても、従来の「二重構造説」は相当疑わしいことになりますね![[たらーっ（汗）]](https://blog.ss-blog.jp/_images_e/163.gif)
。
その後、篠田謙一氏が2016年3月19日にJICAで講演したスライドを見つけました。
DNAから見た日本人の起源―日本人成立の経緯―
国立科学博物館人類研究部 篠田 謙一
そうしたら、なんとその後の2019年の自著↓の記述を否定していたのです！
新版 日本人になった祖先たち DNAが解明する多元的構造 ＮＨＫブックス
- 作者: 篠田 謙一
- 出版社/メーカー: NHK出版
- 発売日: 2019/03/25
- メディア: Kindle版
1. この本には、ミトコンドリア・ハプログループDは「弥生時代になって日本に入ってきたと考える方が自然」（第5章）とありますが、講演のスライド↓には縄文人のD4が示されています。
これは、 ハプログループDは縄文時代に既に入ってきていたということ？ 以前の主張を変更したとは思えないので、非常に考えにくいのですが、ひょっとしたら書き間違え？
2. 講演のスライド↓では、ハプログループD4の中心は山東省や朝鮮半島になっていますが、前回に書いたように、その比率は20%台となります。これは日本の30%台より低いので、中心は山東省ではなく日本です。
3. 山東省の斉の国から山口県下関市・土井ヶ浜遺跡に到来したとされる人々（DHxx）のハプログループD4は、主成分分析の結果によると、現在の日本人のD4のものと同じもののようです。
Diversity in matrilineages among the Jomon individuals of Japan
Fuzuki Mizuno et al.
Annals of Human Biology 2023
ただ、↑の2を考慮すると、実は山東省のD4が縄文・弥生人由来なのか、あるいは縄文・弥生人が山東省に移住したものの、何らかの理由で里帰りしたのか…。
これだけではなんとも言えないので、より詳しい分析が必要になるでしょう。
常識的に考えると、わざわざ300人も来たとなると、何らかの新技術（たとえば最新の水田稲作技術）を持ってきたか、あるいは里帰りとするのが自然だと思います。
↑でもう一つ面白いことは、縄文人（黄色）や弥生人（紫色）のミトコンドリア・ハプログループは、土井ヶ浜遺跡の人々も含め、すべて現代日本人と同じであることです。
これには、
a. そもそも、ミトコンドリア・ハプログループでは地域性を区別しにくい
b. 弥生時代までには、渡来人は無視できるぐらい少人数しか来なかった
c. 半島動乱の時代に日本に渡来した百済・新羅・漢人と同じグループだった
といった可能性が考えられます。
まぁ、なんとも言えませんが、私は個人的にbではないかと思っています。
いずれにしても、従来の「二重構造説」は相当疑わしいことになりますね
。2023-09-06 20:53
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水田稲作が伝来した経路は？ [ゲノム解析で古代史]
自分のための備忘録です。
個人的に、水田稲作が伝来したのは遣唐使の北路、具体的には山東半島⇔北部九州と思っています。
さて、山口県下関市の土井ヶ浜遺跡には、弥生時代に山東半島の斉から来たとされる人骨が静かに眠っています。
https://www.doigahama.jp/
で、この人骨のミトコンドリア・ハプログループはD4b2b1なのです（赤枠↓）。
Population dynamics in the Japanese Archipelago since the Pleistocene revealed by the complete mitochondrial genome sequences
Fuzuki Mizuno et al.
Scientific Reports 2021
https://www.nature.com/articles/s41598-021-91357-2
これは、弥生時代になって急激に増えたタイプです。
前回も書いたように、長野県と神奈川県の縄文人には、このタイプが発見されています（赤枠↓）。
Diversity in matrilineages among the Jomon individuals of Japan
Fuzuki Mizuno et al.
Annals of Human Biology 2023
https://doi.org/10.1080/03014460.2023.2224060
ということは、昔から縄文人は山東省と交流があり、水田稲作もこのルートで伝来した…というのが最も自然なのではないでしょうか？
ちなみに、前回のデータでは、山東省の人々ではD4の率は20%程度で相当高いです。
もっとも、現代日本人ではもっと高い30%以上なので、弥生時代に淘汰圧で増えたのかもしれません。
だとすると、お酒に弱い遺伝子と同じパターンですね。
個人的に、水田稲作が伝来したのは遣唐使の北路、具体的には山東半島⇔北部九州と思っています。
さて、山口県下関市の土井ヶ浜遺跡には、弥生時代に山東半島の斉から来たとされる人骨が静かに眠っています。
https://www.doigahama.jp/
で、この人骨のミトコンドリア・ハプログループはD4b2b1なのです（赤枠↓）。
Population dynamics in the Japanese Archipelago since the Pleistocene revealed by the complete mitochondrial genome sequences
Fuzuki Mizuno et al.
Scientific Reports 2021
https://www.nature.com/articles/s41598-021-91357-2
これは、弥生時代になって急激に増えたタイプです。
前回も書いたように、長野県と神奈川県の縄文人には、このタイプが発見されています（赤枠↓）。
Diversity in matrilineages among the Jomon individuals of Japan
Fuzuki Mizuno et al.
Annals of Human Biology 2023
https://doi.org/10.1080/03014460.2023.2224060
ということは、昔から縄文人は山東省と交流があり、水田稲作もこのルートで伝来した…というのが最も自然なのではないでしょうか？
ちなみに、前回のデータでは、山東省の人々ではD4の率は20%程度で相当高いです。
もっとも、現代日本人ではもっと高い30%以上なので、弥生時代に淘汰圧で増えたのかもしれません。
だとすると、お酒に弱い遺伝子と同じパターンですね。
2023-09-05 22:33
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ミトコンドリア・ハプログループD4a1は本当に渡来系なのか？【続】 [ゲノム解析で古代史]
前回からの続きです。
↑第5章の最初にあるグラフ↓ですが、中国の数値（D4→黒にの背景に白字）が全部間違っている模様です。
元の論文は、巻末の参考文献から探すと、どうやら"Phylogeographic Differentiation of Mitochondrial DNA in Han Chinese"だと思われます。
さて、このTable 4↓のD4（赤線）の中には、D4kという値がありますが、これには"D minus D5 is taken as a proxy for D4"と注釈（下の赤のアンダーライン）があり、つまりD4の値そのものです。
奇妙なことに、この値をD4の各サブクレードの合計に加えてしまっているようで、本来の値のちょうど倍になっています。例は次のとおりです。
①
・D4の値は38.2%ですが、正しくは19.1%？
②
・D4の値は35.2%ですが、正しくは17.6%？
・D5の値（青線）は6.4%ですが、5.9%が正しい？
③④
・D4の値は本来の値のちょうど倍？
また、このグラフにはサンプルサイズが書いてないのです。
元の論文では、1カ所について50人程度なので、さすがにこれでは少なすぎ？
ひょっとして、旧版からもそのまま？
また、ハプログループDは「弥生時代になって日本に入ってきたと考える方が自然」とありますが、これまた間違いのようです。というのは、縄文人にもあるから↓です（赤）。
Diversity in matrilineages among the Jomon individuals of Japan
Fuzuki Mizuno et al.
Annals of Human Biology 2023
https://doi.org/10.1080/03014460.2023.2224060
大丈夫なのかな？
なお、日本のデータについては、本人も執筆者になっている"Mitochondrial Genome Variation in Eastern Asia and the Peopling of Japan"と思われます。
サンプルサイズは1312のようです。
2004年発表ということだから、20年近く前のデータです。いくらなんでも、古すぎでは？
現在のデータを見ると、D4はこの論文の32%より少し高くなっているようです…。
本当に大丈夫なのかな？
日本人になった祖先たち DNAから解明するその多元的構造 (NHKブックス)
- 作者: 篠田 謙一
- 出版社/メーカー: NHK出版
- 発売日: 2007/02/24
- メディア: 単行本（ソフトカバー）
↑第5章の最初にあるグラフ↓ですが、中国の数値（D4→黒にの背景に白字）が全部間違っている模様です
。元の論文は、巻末の参考文献から探すと、どうやら"Phylogeographic Differentiation of Mitochondrial DNA in Han Chinese"だと思われます。
さて、このTable 4↓のD4（赤線）の中には、D4kという値がありますが、これには"D minus D5 is taken as a proxy for D4"と注釈（下の赤のアンダーライン）があり、つまりD4の値そのものです。
奇妙なことに、この値をD4の各サブクレードの合計に加えてしまっているようで、本来の値のちょうど倍になっています。例は次のとおりです。
①
・D4の値は38.2%ですが、正しくは19.1%？
②
・D4の値は35.2%ですが、正しくは17.6%？
・D5の値（青線）は6.4%ですが、5.9%が正しい？
③④
・D4の値は本来の値のちょうど倍？
また、このグラフにはサンプルサイズが書いてないのです。
元の論文では、1カ所について50人程度なので、さすがにこれでは少なすぎ？
ひょっとして、旧版からもそのまま？
また、ハプログループDは「弥生時代になって日本に入ってきたと考える方が自然」とありますが、これまた間違いのようです。というのは、縄文人にもあるから↓です（赤）。
Diversity in matrilineages among the Jomon individuals of Japan
Fuzuki Mizuno et al.
Annals of Human Biology 2023
https://doi.org/10.1080/03014460.2023.2224060
大丈夫なのかな？
なお、日本のデータについては、本人も執筆者になっている"Mitochondrial Genome Variation in Eastern Asia and the Peopling of Japan"と思われます。
サンプルサイズは1312のようです。
2004年発表ということだから、20年近く前のデータです。いくらなんでも、古すぎでは？
現在のデータを見ると、D4はこの論文の32%より少し高くなっているようです…。
本当に大丈夫なのかな？
2023-09-05 22:10
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ミトコンドリア・ハプログループD4a1は長生きなのか？ [ゲノム解析で古代史]
前回の記事に関連して、面白い論文を見つけました。
ミトコンドリア・ハプログループD4aは長生きのマーカーだというのです。
ひょっとしたら、水田稲作に向いているのかもしれません。
Mitochondrial DNA Haplogroup D4a Is a Marker for Extreme Longevity in Japan
Erhan Bilal et al.
PLOS ONE 2008
https://doi.org/10.1371/journal.pone.0002421
それなら、弥生時代になってからD4a1が急増した理由も納得です。
また、中国でも同じ結果が報告されています。
Association of Mitochondrial DNA Haplogroups with Exceptional Longevity in a Chinese Population
Xiao-yun Cai et al.
PLOS ONE 2009.
https://doi.org/10.1371/journal.pone.0006423
別な論文も見つけました。
Relationship between mitochondrial haplogroup and psychophysiological responses during cold exposure in a Japanese population
TAKAYUKI NISHIMURA et al.
Anthropological Science 2011.
https://doi.org/10.1537/ase.101009
この論文によると、ハプログループD4は寒さに強いそうです。
どれが本当なのかな？
ミトコンドリア・ハプログループD4aは長生きのマーカーだというのです。
ひょっとしたら、水田稲作に向いているのかもしれません。
Mitochondrial DNA Haplogroup D4a Is a Marker for Extreme Longevity in Japan
Erhan Bilal et al.
PLOS ONE 2008
https://doi.org/10.1371/journal.pone.0002421
それなら、弥生時代になってからD4a1が急増した理由も納得です。
また、中国でも同じ結果が報告されています。
Association of Mitochondrial DNA Haplogroups with Exceptional Longevity in a Chinese Population
Xiao-yun Cai et al.
PLOS ONE 2009.
https://doi.org/10.1371/journal.pone.0006423
別な論文も見つけました。
Relationship between mitochondrial haplogroup and psychophysiological responses during cold exposure in a Japanese population
TAKAYUKI NISHIMURA et al.
Anthropological Science 2011.
https://doi.org/10.1537/ase.101009
この論文によると、ハプログループD4は寒さに強いそうです。
どれが本当なのかな？
2023-09-02 01:16
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ミトコンドリア・ハプログループD4a1は本当に渡来系なのか？ [ゲノム解析で古代史]
前回の記事では、通説では渡来系とされているD4a1↓は、意外と現代日本人に多いと書きました。
常識的に考えると、このハプログループが朝鮮半島由来だとすると、日本人よりは割合が高いはずです。
そこで、現代日本人と現代韓国人の割合を調べることにします。
とは言っても、ハプログループD4a1に限定するのは難しいので、D4の割合を調べてみました。
日本人についてですが、このサイトによれば、篠田謙一氏『日本人になった祖先たち』に、D4は32.61%とあるのだそうです。
韓国人については、とりあえず英語版Wikipediaなどで調べてみたところ、2つのデータが見つかりました。
1. The Peopling of Korea Revealed by Analyses of Mitochondrial DNA and Y-Chromosomal Markers
Han-Jun Jin et al.
PLoS One. 2009; 4(1): e4210.
https://doi.org/10.1371/journal.pone.0004210
2. Phylogeographic Analysis of Mitochondrial DNA in Northern Asian Populations
Miroslava Derenko et al.
American Journal of Human Genetics 2007
https://doi.org/10.1086/522933
→32.0% (103人を調査)
なんと、どちらも日本人の32.61%より割合が低いのです！
※1より2の方がサンプルが少ないので、2の32.0%という数字は高めに出ているかもしれません…。
1によると、半島から北に行くほど割合が低下するので、日本→朝鮮半島→中国大陸というルートの方がありそうです。
また、D4a1の発生は1万年ぐらい前と推測されていますが、当時は事実上無人だった朝鮮半島で発生するとは考えにくいです。
これらのことから、渡来系とされているD4a1は、もともとは縄文人の住んでいた日本で発生した可能性が高いと思われます。
だんだん馬鹿馬鹿しくなってきますね。
なんだかなぁ～。
常識的に考えると、このハプログループが朝鮮半島由来だとすると、日本人よりは割合が高いはずです。
そこで、現代日本人と現代韓国人の割合を調べることにします。
とは言っても、ハプログループD4a1に限定するのは難しいので、D4の割合を調べてみました。
日本人についてですが、このサイトによれば、篠田謙一氏『日本人になった祖先たち』に、D4は32.61%とあるのだそうです。
日本人になった祖先たち DNAから解明するその多元的構造 (NHKブックス)
- 作者: 篠田 謙一
- 出版社/メーカー: NHK出版
- 発売日: 2007/02/24
- メディア: 単行本（ソフトカバー）
韓国人については、とりあえず英語版Wikipediaなどで調べてみたところ、2つのデータが見つかりました。
1. The Peopling of Korea Revealed by Analyses of Mitochondrial DNA and Y-Chromosomal Markers
Han-Jun Jin et al.
PLoS One. 2009; 4(1): e4210.
https://doi.org/10.1371/journal.pone.0004210
The highest (23.8%) frequency in the Korean mtDNA pool was observed for haplogroup D4, which is widespread in northern East Asia and especially in the Korean-Chinese (21.6%), and Manchurians (20.0%). In total, haplogroup D lineages including the subhaplogroups (D4, D4a, D4b, D5, and D5a) accounted for 32.4% of the Korean mtDNA pool.→23.8% (185人を調査)
2. Phylogeographic Analysis of Mitochondrial DNA in Northern Asian Populations
Miroslava Derenko et al.
American Journal of Human Genetics 2007
https://doi.org/10.1086/522933
→32.0% (103人を調査)
なんと、どちらも日本人の32.61%より割合が低いのです！
※1より2の方がサンプルが少ないので、2の32.0%という数字は高めに出ているかもしれません…。
1によると、半島から北に行くほど割合が低下するので、日本→朝鮮半島→中国大陸というルートの方がありそうです。
また、D4a1の発生は1万年ぐらい前と推測されていますが、当時は事実上無人だった朝鮮半島で発生するとは考えにくいです。
これらのことから、渡来系とされているD4a1は、もともとは縄文人の住んでいた日本で発生した可能性が高いと思われます。
だんだん馬鹿馬鹿しくなってきますね。
なんだかなぁ～。
2023-09-02 00:15
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現在までの縄文人のミトコンドリア・ハプログループ [ゲノム解析で古代史]
自分のための備忘録です。
現在までの縄文人のミトコンドリア・ハプログループをまとめました。
それにしても、2023年の水野文月さんの論文はすごいですね。
ところで、WikipediaでハプログループD（英語版）を見ると、結構日本が多い。
特に、通説では渡来系とされているD4a1↓は、意外と現代日本人に多く、
おそらく日本列島が起源ではないかと思うんですが、これだけではなんとも言えませんね。
○学際的研究で明らかにする関東地方縄文時代人の人類学的・考古学的実像
安達登，坂上和弘，澤田 純明
科研費研究成果報告書 2013
https://kaken.nii.ac.jp/ja/file/KAKENHI-PROJECT-23570280/23570280seika.pdf
※↑左のグラフの関東縄文時代人のD4は11人（56人×19.4%=11人）のはずなのですが、2023年の水野文月さんの論文のリストには含まれていないようです。ひょっとしたら、これがD4a1？
○佐世保市岩下洞穴および下本山岩陰遺跡出土人骨のミトコンドリアDNA分析
Anthropological Science (Japanese Series)
篠田謙一，神澤秀明，角田恒雄，安達登 2017
下本山2号(女性M7a1a4)及び3号(男性D4a1)
https://www.jstage.jst.go.jp/article/asj/125/1/125_170509/_pdf
○西北九州弥生人の遺伝的な特徴―佐世保市下本山岩陰遺跡出土人骨の核ゲノム解析
Anthropological Science (Japanese Series)
篠田謙一，神澤秀明，角田恒雄，安達登 2019
下本山2号(女性 mt:M7a1a4)及び3号(男性 mt:D4a1, Y:O)
https://www.jstage.jst.go.jp/article/asj/127/1/127_1904231/_pdf
○鳥取県鳥取市青谷上寺地遺跡出土弥生後期人骨のDNA分析
国立歴史民俗博物館研究報告
篠田謙一・神澤秀明・角田恒雄・安達登 2020
https://rekihaku.repo.nii.ac.jp/record/2531/files/kenkyuhokoku_219_11.pdf
※この報告書には、渡来系が多いとありますが、Y染色体もミトコンドリアも、その多くが縄文人にもあるタイプのようです。
○鹿児島県宝島大池遺跡B地点出土貝塚前期人骨のＤＮＡ分析
国立歴史民俗博物館研究報告
神澤秀明，角田恒雄，安達登，篠田謙一 2020
大池１号 M7a1a
https://rekihaku.repo.nii.ac.jp/record/2539/files/kenkyuhokoku_219_19.pdf
○鳥取県鳥取市青谷上寺地遺跡出土弥生後期人骨の核DNA分析
国立歴史民俗博物館研究報告
神澤秀明・角田恒雄・安達登・篠田謙一 2021
https://rekihaku.repo.nii.ac.jp/record/2670/files/kenkyuhokoku_228_24.pdf
○鹿児島県徳之島所在遺跡出土人骨のミトコンドリアDNA分析
国立歴史民俗博物館研究報告
篠田謙一・神澤秀明・角田恒雄・安達登・竹中正巳 2021
https://rekihaku.repo.nii.ac.jp/record/2687/files/kenkyuhokoku_228_41.pdf
○鹿児島県内出土縄文人骨のミトコンドリアDNA分析
国立歴史民俗博物館研究報告
篠田謙一・神澤秀明・角田恒雄・安達登・竹中正巳 2021
https://rekihaku.repo.nii.ac.jp/record/2681/files/kenkyuhokoku_228_35.pdf
○茨城県教育財団文化財調査報告第446集
下河原崎高山古墳群２
令和２年３月
上河原崎・中西特定土地区画整理
事業地内埋蔵文化財調査報告書６
骨番号512 不明
骨番号593 D4j?
骨番号594 G2
骨番号595 D4a?
骨番号611 A
骨番号871 D4e
骨番号963 D4
骨番号1015 D4
https://sitereports.nabunken.go.jp/files/attach/36/36886/71156_1_%E4%B8%8B%E6%B2%B3%E5%8E%9F%E5%B4%8E%E9%AB%98%E5%B1%B1%E5%8F%A4%E5%A2%B3%E7%BE%A4%EF%BC%92.pdf
○本土日本人の起源の解明：弥生時代のゲノム解析
水野文月
科研費報告書 2019
https://kaken.nii.ac.jp/ja/file/KAKENHI-PROJECT-17K07588/17K07588seika.pdf
（データなし）
○Population dynamics in the Japanese Archipelago since the Pleistocene revealed by the complete mitochondrial genome sequences
Fuzuki Mizuno et al.
Scientific Reports 2021
https://www.nature.com/articles/s41598-021-91357-2
○Diversity in matrilineages among the Jomon individuals of Japan
Fuzuki Mizuno et al.
Annals of Human Biology 2023
https://doi.org/10.1080/03014460.2023.2224060
○Northeastern Asian and Jomon-related genetic structure in the Three Kingdoms period of Gimhae, Korea
Pere Gelabert et al.
Current Biology 2022
https://www.heas.at/wp-content/uploads/2022/06/Gelabert-et-al.-2022_compressed.pdf
※この論文には、金海の人々は縄文人と紅山文化人との混血とあり、後者のY染色体のハプログループNが67%と過半数になるはずが、示されているデータにはNがありません。また、紅山文化人のミトコンドリアのデータは見つからないようなので、「混血」の根拠が不明です。逆に、弥生人とするなら、どちらも一致するため、すっきりと説明できます。
現在までの縄文人のミトコンドリア・ハプログループをまとめました。
それにしても、2023年の水野文月さんの論文はすごいですね。
ところで、WikipediaでハプログループD（英語版）を見ると、結構日本が多い。
特に、通説では渡来系とされているD4a1↓は、意外と現代日本人に多く、
おそらく日本列島が起源ではないかと思うんですが、これだけではなんとも言えませんね。
○学際的研究で明らかにする関東地方縄文時代人の人類学的・考古学的実像
安達登，坂上和弘，澤田 純明
科研費研究成果報告書 2013
https://kaken.nii.ac.jp/ja/file/KAKENHI-PROJECT-23570280/23570280seika.pdf
※↑左のグラフの関東縄文時代人のD4は11人（56人×19.4%=11人）のはずなのですが、2023年の水野文月さんの論文のリストには含まれていないようです。ひょっとしたら、これがD4a1？
○佐世保市岩下洞穴および下本山岩陰遺跡出土人骨のミトコンドリアDNA分析
Anthropological Science (Japanese Series)
篠田謙一，神澤秀明，角田恒雄，安達登 2017
下本山2号(女性M7a1a4)及び3号(男性D4a1)
https://www.jstage.jst.go.jp/article/asj/125/1/125_170509/_pdf
○西北九州弥生人の遺伝的な特徴―佐世保市下本山岩陰遺跡出土人骨の核ゲノム解析
Anthropological Science (Japanese Series)
篠田謙一，神澤秀明，角田恒雄，安達登 2019
下本山2号(女性 mt:M7a1a4)及び3号(男性 mt:D4a1, Y:O)
https://www.jstage.jst.go.jp/article/asj/127/1/127_1904231/_pdf
○鳥取県鳥取市青谷上寺地遺跡出土弥生後期人骨のDNA分析
国立歴史民俗博物館研究報告
篠田謙一・神澤秀明・角田恒雄・安達登 2020
https://rekihaku.repo.nii.ac.jp/record/2531/files/kenkyuhokoku_219_11.pdf
※この報告書には、渡来系が多いとありますが、Y染色体もミトコンドリアも、その多くが縄文人にもあるタイプのようです。
○鹿児島県宝島大池遺跡B地点出土貝塚前期人骨のＤＮＡ分析
国立歴史民俗博物館研究報告
神澤秀明，角田恒雄，安達登，篠田謙一 2020
大池１号 M7a1a
https://rekihaku.repo.nii.ac.jp/record/2539/files/kenkyuhokoku_219_19.pdf
○鳥取県鳥取市青谷上寺地遺跡出土弥生後期人骨の核DNA分析
国立歴史民俗博物館研究報告
神澤秀明・角田恒雄・安達登・篠田謙一 2021
https://rekihaku.repo.nii.ac.jp/record/2670/files/kenkyuhokoku_228_24.pdf
○鹿児島県徳之島所在遺跡出土人骨のミトコンドリアDNA分析
国立歴史民俗博物館研究報告
篠田謙一・神澤秀明・角田恒雄・安達登・竹中正巳 2021
https://rekihaku.repo.nii.ac.jp/record/2687/files/kenkyuhokoku_228_41.pdf
○鹿児島県内出土縄文人骨のミトコンドリアDNA分析
国立歴史民俗博物館研究報告
篠田謙一・神澤秀明・角田恒雄・安達登・竹中正巳 2021
https://rekihaku.repo.nii.ac.jp/record/2681/files/kenkyuhokoku_228_35.pdf
○茨城県教育財団文化財調査報告第446集
下河原崎高山古墳群２
令和２年３月
上河原崎・中西特定土地区画整理
事業地内埋蔵文化財調査報告書６
骨番号512 不明
骨番号593 D4j?
骨番号594 G2
骨番号595 D4a?
骨番号611 A
骨番号871 D4e
骨番号963 D4
骨番号1015 D4
https://sitereports.nabunken.go.jp/files/attach/36/36886/71156_1_%E4%B8%8B%E6%B2%B3%E5%8E%9F%E5%B4%8E%E9%AB%98%E5%B1%B1%E5%8F%A4%E5%A2%B3%E7%BE%A4%EF%BC%92.pdf
○本土日本人の起源の解明：弥生時代のゲノム解析
水野文月
科研費報告書 2019
https://kaken.nii.ac.jp/ja/file/KAKENHI-PROJECT-17K07588/17K07588seika.pdf
（データなし）
○Population dynamics in the Japanese Archipelago since the Pleistocene revealed by the complete mitochondrial genome sequences
Fuzuki Mizuno et al.
Scientific Reports 2021
https://www.nature.com/articles/s41598-021-91357-2
○Diversity in matrilineages among the Jomon individuals of Japan
Fuzuki Mizuno et al.
Annals of Human Biology 2023
https://doi.org/10.1080/03014460.2023.2224060
○Northeastern Asian and Jomon-related genetic structure in the Three Kingdoms period of Gimhae, Korea
Pere Gelabert et al.
Current Biology 2022
https://www.heas.at/wp-content/uploads/2022/06/Gelabert-et-al.-2022_compressed.pdf
※この論文には、金海の人々は縄文人と紅山文化人との混血とあり、後者のY染色体のハプログループNが67%と過半数になるはずが、示されているデータにはNがありません。また、紅山文化人のミトコンドリアのデータは見つからないようなので、「混血」の根拠が不明です。逆に、弥生人とするなら、どちらも一致するため、すっきりと説明できます。
2023-09-01 22:13
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知り合いが血液型のAIを作りました [サイト紹介]
知り合いが、血液型のAIを作ったので紹介します。
redGPT : https://gptbots.ai/s/cMLaX4uB
基本は中国語ですが、英語も日本語も使えるとのことです。
すごいなぁ。
バチバチ。
redGPT : https://gptbots.ai/s/cMLaX4uB
基本は中国語ですが、英語も日本語も使えるとのことです。
すごいなぁ。
バチバチ。
2023-08-16 20:08
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藤川賢治さん マスク社会に終止符を!!：コロナとワクチン、統計情報のトリックを曝く [新型コロナ]
マスク社会に終止符を!!：コロナとワクチン、統計情報のトリックを曝く
- 作者: 藤川 賢治
- 出版社/メーカー: 花伝社
- 発売日: 2023/08/23
- メディア: 単行本（ソフトカバー）
知り合いの藤川さんが新著を出したので、紹介します。
おめでとうございます！
2023-07-29 09:53
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