韓国のデータの入手方法 [ゲノム解析で古代史]
Genome1000プロジェクトのデータには、フリーで使えるVCFファイルがあるのですが、日本も中国もベトナムもあるのに、なぜか韓国がありません。
最近、フリーで入手できるサイトを見つけたので報告します。
KoreanGenome.org
※下から2行目のThe VCF files of Korean Genomes: FTP at Biodiskに注目!
なお、このサイトのリンクは、
・ftp://biodisk.org/Release/KPGP/
KPGP_Data_2014_Release_Candidate/WGS_VCF/
となっていますが、最新版は、
・ftp://biodisk.org/Release/KPGP/
KPGP_Data_2019_Release_Candidate/
WGS_SR_VCF_91_KOREAN_JOINT_CALL/
の「chrX.snv.recalibrated.vcf」のようです。
サイズは1-3GB程度ですので、なんとかダウンロード可能でした
最近、フリーで入手できるサイトを見つけたので報告します。
KoreanGenome.org
※下から2行目のThe VCF files of Korean Genomes: FTP at Biodiskに注目!
なお、このサイトのリンクは、
・ftp://biodisk.org/Release/KPGP/
KPGP_Data_2014_Release_Candidate/WGS_VCF/
となっていますが、最新版は、
・ftp://biodisk.org/Release/KPGP/
KPGP_Data_2019_Release_Candidate/
WGS_SR_VCF_91_KOREAN_JOINT_CALL/
の「chrX.snv.recalibrated.vcf」のようです。
サイズは1-3GB程度ですので、なんとかダウンロード可能でした
2022-03-02 22:38
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